linuxのファイルシステムであるext2やext2は、e2fsckコマンドでのエラーチェックします。
rootパーティションは、そのままでエラーチェックできません。
# e2fsck /dev/sda1 e2fsck 1.41.3 (12-Oct-2008) /dev/sda1 is mounted. WARNING!!! Running e2fsck on a mounted filesystem may cause SEVERE filesystem damage. Do you really want to continue (y/n)? no check aborted. #
チェックする場合には、シングルユーザモードで起動します。
# init 0; exit
それからエラーチェックを実行します。
チェックが終わったらマウントし直します。
ログアウトするとマルチユーザモードで立ち上がります。